pCas9 gRNA3基因敲除载体对照实验
实验原理
pTYNE载体在EGFP编码框上游有2个错码的ATG起始密码子,由于不能有效地启动EGFP表达,pTYNE转染细胞仅能发出很微弱的荧光。
pCas9/gRNA3载体需要成对发挥作用。我们根据pTYNE载体设计构建了pCas9/gRNA3阳性对照载体pCAS9-Pf、pCas9-Pr。由于Cas9Nicknase对一个靶点切割后形成的DNA单链断裂会被修复,几乎不会引起DNA序列改变。我们用pCAS9-Pf与pTYNE共转染作为阴性对照组,pCAS9-Pf、pCas9-Pr与pTYNE三个质粒共转染作为阳性对照组。pCAS9-Pf、pCas9-Pr共同切割pTYNE载体,使pTYNE载体DNA双链断裂,经细胞修复后,突变的pTYNE将表达出读码框正确的EGFP蛋白,发出明亮的绿色荧光。
pCas9/gRNA3阳性对照载体(pCas9-Pf)靶序列:CGAAGCTTGAGCTCGAGCCA。
pCas9/gRNA3阳性对照载体(pCas9-Pr)靶序列:TACCGCGGGCCCGGGATCCT。
Pf、Pr靶点在pTYNE载体上的位置:
Cas9Nicknase切割原理:
实验内容
1、实验材料
pTYNE质粒(验证载体,无内毒素试剂盒制备;货号:CR1011)
pCas9-Pf质粒(pCas9/gRNA3阳性对照,货号:CR1012,无内毒素试剂盒制备)
pCas9-Pr质粒(pCas9/gRNA3阳性对照,货号:CR1012,无内毒素试剂盒制备)
Polyfect-V转染试剂(货号:P2010-1)
293T细胞系
2、实验步骤
1) 转染前24小时将293T铺到24孔板中。同时准备2个孔。
2) 按照下列体系制备2个质粒稀释液
组A |
组B |
pTYNE 0.4ug |
pTYNE 0.4ug |
pCas9-Pf 0.4ug |
pCas9-Pf 0.2ug |
- | pCas9-Pr 0.2ug |
DMEM培养基X ul |
DMEM培养基 X ul |
总体积50ul |
总体积50ul |
3) 准备转染试剂稀释液:
Polyfect-V转染试剂 3.2ul
DMEM培养基 96.8ul
4) 将质粒稀释液和转染试剂稀释液分别混匀。取50ul转染试剂稀释液分别加入两组质粒稀释液中,充分混匀,室温孵育15min。
5) 将转染液加入293T细胞。
6) 48小时后检测EGFP荧光表达。
实验结果
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